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Graphpad Prism集训营实战案例5连发

[时间:2019-09-30 03:13来源:未知作者:admin浏览:]

  同时承诺向广州亚组委捐款三千万元人民币,推动和完善亚运会马术比赛顺利展开。

  Graphpad Prism号称作图神器,名头可不简单。咱们想要得心应手,先要了解自己的数据,掌握好它本身的图形设计思路后,还能通过巧妙的数据变换做出更富有表现力的图形哦~

  第1题比较基础,咱们讲详细点,照顾一下没了解过的盆友。会做的小伙伴可以直接跳到第2题了。

  先观察一下,这是很明显的二维分组数据,一个是细胞分组(MGC-803、SGC-7901),一个是基因编辑分组(Vector、CISD2、RNAi-vector、RNAi1、RNAi2)。所以我们新建数据集的时候选择Grouped。

  把数据贴上,然后双击左边目录中Graphs下相应的图形按钮,选择summary data选项卡中相应的图形,就出图了。

  呃,截图时忘了去掉show legend那个勾了=_=你知道就好。然后如果想马上看效果就先点Apply,然后继续在这个框里换一根柱子继续调。或者有耐心点的就调完所有柱子再点OK。

  不过这样柱子还是胖胖的,再双击回到刚才的界面,最右的选项卡Graph Settings:

  接着直接在图上改纵坐标轴名称。再用画线和文字工具添加大组名称(行标题),并设置文字样式。

  这回有三个分组因素,比刚才多了一个周期分组(G0/G1 phase、S phase、G2/M phase)。有心的小伙伴可能会发现,这个三维分组数据的组织形式跟Prism软件示例中不一样呢。

  如果要使用软件中的三因素方差分析(Three-way ANOVA),则需要像下图中这样组织数据:

  行为单一分组因素,一行一组,而在列上整合两个分组因素,总列数为两个因素分组数的乘积,如果中处理方式有2组,剂量有2组,则总列数为2×2=4。

  但再看看示例图,我们需要一个堆积柱状图来观察不同周期的比例,这并不是Three-way的出图方式。

  而当你用那样的三维数据表去选Plot summary data中的堆积柱状图时,好像又不是这么回事……

  看来它是必须每行作为一根柱子,各列一起堆上去的。所以需要对数据做一些变换,变成我们摸拟示列中的那个样子。不过这样,细胞分组貌似只有自己心知肚明了。而且,作Three-way ANOVA分析的时候,会提示数据组织形式不对。所以你可能需要保留两份数据表。

  接下来的外观调整跟上边的做法大同小异,就不重复了。只是在柱子堆积的排序上,跟示例图不一样,可以在外观选项卡旁边的Data Sets on Graph中调整。

  还有最后的一个问题,两种细胞分组之间的距离分不开,用刚才的方法好像不凑效,怎么办?

  那是因为数据组织形式不一样了,各组已经堆起来了。所以现在应该在两组间加一个空行:

  这样看起来好像跟第1题一样的嘛,二维分组数据。但再仔细看看,第1题的各大组内,每根柱子用不同的颜色区分,而这里,同一个大组中各柱子的填充是一样的。如果按这样的数据排布方式来选择分离柱状图:

  阿森纳足球俱乐部(Arsenal Football Club),简称阿森纳队,是一家位于英国首都伦敦西北部的足球俱乐部,成立于1886年,是英格兰顶级联赛英格兰超级联赛二十个足球俱乐部球队之一,俱乐部基地位于伦敦荷洛(Holloway)。

  第1题中的交错柱状图(interleaved bar)是以行区分大组,以列区的不同颜色分各柱子;而分离柱状图(Separated bar)可理解为以列区分各大组,但也可理解为仍是以行区分大组,但把每组中相同成分(列)提取出来,在图上拆分排布,所以叫分离柱状图。

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  目前,犯罪嫌疑人胡某某已被甘州区公安局依法刑事拘留,案件深挖和追赃工作正在进行中。

  最后一点是Y轴的截断,因为各组数据值差得太大,小的那些组几乎看不到了,像示例图那样截断能看到一些细节。我们之前在《你终于会做截断图了,可审稿人说不让做,怎么破?》中讲解过,还提到另一种处理方式,大家可以看情况选用哦。

  此外,不法分子肖某利用网络搜集广东省相关地区政府部门领导的信息,雕刻假公章,制作假公文,冒充省纪委监察厅人员,寄送勒索信件给有关领导。而江门台山、韶关翁源、茂名信宜等地纪检监察机关都收到一份以广东省纪委、省监察厅名义,要求征订业务书籍的传真。

  其实数据表很长,有45行,我只截了一部分。刚才的柱状图都是将一组数据经过汇总计算,在图上展示它们的平均分、标准差等描述性统计量。而现在是把每个数据点都展示出来,用纵横坐标来描述位置,观察它们的分布特征。所以创建表格时要选择XY形式:

  原来X轴上的值跨度太大了,从0.5到几万,适合做对数转换,像示例中2n那样。双击X轴设置:

  嗯,要是还觉得215后边还有一点延长不满意,那只好计算一下215=32768,把这个数填回刚才填40000的地方。

  仔细想想,剂量是有递增关系的数值,钦州林湖森林公园。旁边几个处理组也是一一对应的数值,所以也是XY图。不过数据录入方式不一样,不是第4题那种原始数据了,而是已经把平均值、标准差、样本量计算整理好了。所以在创建表格的时候也有相应的选择。

  选择具体图形的时候再想想,这数据是记录不同处理方式下,剂量递增时细胞的生存情况,目的是要看变化趋势,所以最好是点线图不是散点图。

  后面的内容基本都讲过了。主要提醒一下X轴,这回是太小而不是太大,所以可以选择科学计数法:

  其实把剂量看成一种分组因素也未尝不可,那就成为二维分组数据,可做成柱状图:

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